任何一门学科的发展与进步都离不开科研活动。我系中西医结合方面的科研也推动了中西医结合学科的发展。中西医结合基础学科创建于1958年，经过近半个世纪的建设与发展，本学科点现已拥有中西医结合白内障临床与基础研究、中西医结合肝病临床与基础研究、中西医结合肿瘤临床与基础研究、中西医结合消化系疾病临床与基础研究、中西医结合糖尿病临床与基础研究、中西医结合应用解剖学研究等科研方向；有一个国家中医药管理局重点实验室：病理生理学实验室；本学科拥有的“中西医结合基础”和“病理学与病理生理学”两个硕士点均填补我省空白。

本学科研究方向的共同特色在于结合中医理论，应用现代生理学、病理生理学、细胞生物学、生物化学、细胞遗传学、分子生物学以及细胞培养技术、电生理技术、免疫组化技术、信号转导技术、动物模型研究、离体与在体研究等手段来开展中医中药的基础研究，已培养硕士毕业生70多名，现有中西医结合基础硕士生33 人。